Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPC1L1Q9UHC9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms