Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FANCFQ9NPI8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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