Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms