Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG6Q9BXT2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms