Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BBS2Q9BXC9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms