Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms