Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3R4Q99570 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms