Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD1Q969G9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms