Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC71Q8IV32 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC71Q8IV32 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms