Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms