Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
REEP3Q6NUK4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms