Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms