Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms