Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RBBP7Q16576 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms