Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC6Q16204 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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