Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS72Q15906 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms