Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAPSNQ13702 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms