Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR3Q13615 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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