Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE3BQ13370 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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