Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMAN2Q12907 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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