Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYP4F3Q08477 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms