Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FPGSQ05932 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FPGSQ05932 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FPGSQ05932 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
FPGSQ05932 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FPGSQ05932 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms