Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALD1Q05682 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms