Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms