Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DSG1Q02413 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms