Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB1P82279 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CRB1P82279 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRB1P82279 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRB1P82279 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRB1P82279 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB1P82279 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB1P82279 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms