Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMSP52788 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMSP52788 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMSP52788 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMSP52788 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMSP52788 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SMSP52788 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMSP52788 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMSP52788 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMSP52788 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms