Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX2P50458 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX2P50458 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX2P50458 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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