Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBRP36941 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBRP36941 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms