Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP5C1P36542 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms