Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms