Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLD1P28340 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLD1P28340 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLD1P28340 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLD1P28340 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLD1P28340 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms