Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
POLA1P09884 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLA1P09884 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLA1P09884 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLA1P09884 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLA1P09884 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLA1P09884 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLA1P09884 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLA1P09884 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLA1P09884 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLA1P09884 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLA1P09884 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLA1P09884 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLA1P09884 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLA1P09884 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLA1P09884 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLA1P09884 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLA1P09884 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLA1P09884 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLA1P09884 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms