Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGAVP06756 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGAVP06756 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms