Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPLO60437 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPLO60437 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPLO60437 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPLO60437 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPLO60437 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPLO60437 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPLO60437 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPLO60437 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPLO60437 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPLO60437 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPLO60437 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPLO60437 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPLO60437 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPLO60437 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms