Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1Q9Y3L3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SH3BP1Q9Y3L3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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