Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms