Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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