Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTNNAL1Q9UBT7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTNNAL1Q9UBT7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms