Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3AQ9NVI7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms