Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms