Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
KRTAP2-4Q9BYR9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms