Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL110292.1-201ENST00000550024 477 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000350.5-201ENST00000609825 613 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090568.2-206ENST00000521936 1469 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL36G-201ENST00000259205 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPRR3-202ENST00000331860 985 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 HULC-201ENST00000503668 556 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP9-3Q9BYQ3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms