Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTKNQ9BST9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms