Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP9Q99956 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP9Q99956 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms