Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms