Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APCDD1LQ8NCL9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APCDD1LQ8NCL9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms