Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CDX2-201ENST00000381020 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 NPY2R-202ENST00000506608 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 AL122008.3-201ENST00000412483 1723 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
OBSCNQ5VST9 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms