Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KNOP1Q1ED39 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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