Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms